Вот наткнулся на github - https://github.com/mifi/lossless-cut На основе ffmpeg GUI для ffmpeg, вырезает, склеивает, без перекодировки, в разделе releases , есть готовые сборки под windows,osX, linux P.S. Ну и вообще ffmprg, позволяет делать с видео всё что возможно, только вот в опциях разбираться, это свихнуться можно.