На некоторых Нормальных мамках есть предохранители на платах - проверь +5 вольт на портах .
Есть еще платы расширения ЮСБ PCI и PCI-e Как временная мера.
Если южак подох я бы менял мать.
Есть подозрение что виноват БП . Ещё бывает - Перегруз порта USB-HDD при перегретом южаке .