С централизованной архитектурой FFCS без MSSQL никак, дело в том что он в комплекте имеет MOM, который как раз и требует скул, а прочих радостей и не надо, зато вы получаете централизованную систему по управлению и развертыванию клиентских антивирусных программ, статистику, уведомление и прочие административные бонусы, к тому же по идеи можно использовать МОМ для мониторинга других сервисов, если предварительно импортировать менеджмент паки, на деле это не пробовал ибо уже есть SCOM. Также возможно использовать FFCS без центрального сервера, но в этом все плюшки нивелируются, но бесплатно